依據「行政院洗錢防制辦公室設置要點」第1條規定，本辦公室之成立目標為「提升我國洗錢防制及打擊資恐資武擴效能，並督導統籌亞太防制洗錢組織相互評鑑程序」。

另依據同要點第2點規定，本辦公室之任務如下：

(一)統籌我國洗錢防制與打擊資恐資武擴政策及執行策略。

(二)執行我國洗錢防制及打擊資恐資武擴風險評估。

(三)督導統籌亞太防制洗錢組織相互評鑑事宜。

(四)督導各政府機關(構)、私法人、團體或機構進行機構風險評估。

(五)推動洗錢防制與打擊資恐資武擴國內外宣導及教育訓練。

(六)參與亞太防制洗錢組織年會並舉辦相關會議。

(七)其他與我國洗錢防制、打擊資恐資武擴及亞太防制洗錢組織相互評鑑相關事宜。